Серий: 13 · с 6 января 2009
Второй сезон истории повествует о продолжении приключений Такаши Нацумэ — юноши, с детства имеющего способность видеть духов — и его телохранителя Мадары, названного Нянко-сэнсэем. Такаши продолжает возвращать духам их имена, освобождая их от «Тетради дружбы», унаследованной от бабушки Рэйко. Он сталкивается с духами, демонами, помогает им и часто попадает в ситуации, опасные как для него, так и для окружающих.
Находясь на улице во время урока, Нацумэ получает удар мячом, когда читает. Он идёт за мячом и в итоге ломает печать ёкая (точно так же, как это случилось с Нянко-сэнсэем). Позже той ночью Нацумэ и Нянко-сэнсэй обнаруживают двойника Нянко, который крадет Книгу Друзей!
Во время игр в снегу Нацумэ и Нянко-сэнсэй натыкаются на Гена, лесного стража, живущего внутри статуи. Ген пытается вселиться в тело Нацумэ, но вместо этого вселяется в снежного кролика, которого Нацумэ сделал сам. Ген умоляет Нацумэ помочь ему найти злого духа, уничтожившего Суи, его напарника-хранителя, и Нацумэ соглашается. Но, похоже, Ген рассказывает не всё, что должен...
Натори приглашает Нацумэ в поездку на горячие источники. Но шум из шкафа и фигура в кимоно, свисающая с потолка, вызывают у Нацумэ беспокойство. Не желая беспокоить Натори за его любезное предложение провести время на горячих источниках, Нацумэ отправляется исследовать источник сам. Ночью Нацумэ встречает ёкая, которая замечает, что он слишком мягкий, и нападает!
Нацумэ заботится о брошенном яйце из гнезда, не предполагая, что это может быть ёкай. После того, как из него вылупляется ёкай, оказывается, что это редкий маленький дух по имени Тацуми, который считает Нацумэ своим родителем. Нацумэ не может не привязаться к маленькому духу, даже когда Тацуми устаёт и заболевает. Но пока Нацумэ заботится о Тацуми, появляется таинственный дух, который хочет забрать Тацуми к его хозяину… а тот хочет его съесть!
Нацумэ встречает духа, порабощенного его бабушкой Рейко 50 лет назад. Для этого он пишет свое имя на вырванной странице из Книги Друзей и привязывает ее к дереву в лесу. Сможет ли Нацумэ помочь найти эту вырванную страницу? Какова была цель Рейко, привязавшей ее к дереву?
В школе появилась новая девочка, Таки Тоору. И с её появлением на земле появились странные круги. Очень похожие на круги от НЛО. Пока Нацумэ пытается разгадать загадку кругов и понять, что это за Таки, к нему приходит другой ёкай. Только на этот раз ёкай ищет не его имя, а что-нибудь перекусить.
Нацумэ затаскивают в пещеру злого духа, который охотится за Тоору. После отравления он временно теряет способность видеть ёкаев. Сможет ли он остановить ёкаев, пытающихся съесть Тоору, не видя его?
Нацумэ, Китомото и Нисимура отправляются в старинную гостиницу, чтобы провести время за выполнением домашнего задания. Вокруг гостиницы раскинулось озеро, которое, как считается, является домом для русалки.
С того самого дня, как Нацумэ получил фотографию ряда вишневых деревьев в суровую зимнюю пору, каждый раз, когда он просыпается, его комната оказывается покрыта лепестками. Пытаясь разгадать причину этого явления, Нацумэ и Няко-сэнсэй пытаются вернуть фотографию Мие, таинственной фигуре, сопровождающей снимок. Но почему они не могут вернуть её Мие...?
На воротах дома Фудзивара видны загадочные следы и метки. Внутри дома начинают происходить странные вещи, и Сигэру уточняет у Нацумэ, что причина этих явлений связана с супругами, которые раньше там жили. И Сигэру рассказывает историю об этих двоих, но в необычайно детской манере...
После погони за раненым ёкаем Нацумэ встречает Натори, который приглашает его на собрание колдунов. Там Нацумэ знакомится с другими людьми, обладающими схожими способностями и имеющими схожие проблемы.
В доме, о котором ходят слухи, что там обитают призраки, Нацумэ слышит детский голос. Следуя за голосом до его источника, Нацумэ находит ребёнка по имени Кай, запертого в ящике, похожем на гроб. Кай рассказывает Нацумэ, что его каждый день кто-то преследует.
Почему ты до сих пор не решил? Что для тебя важнее? Когда Нацумэ узнает, кто такой Кай на самом деле, именно об этом его и спрашивает Натори.